Новый метод обеспечивает более быструю и точную идентификацию патогенов даже в сложных последовательностях ДНК.

Команда исследователей из Медицинской школы Университета Кейс Вестерн Резерв разработала новый метод амплификации, тестирования и анализа целевой последовательности ДНК.

Этот новый метод или реакция, известная как AMPLON (амплификация ДНК с помощью многоветвевого прайминга и циклической оптимизации нуклеиновой кислоты), предлагает альтернативу ранее принятому методу полимеразной цепной реакции (ПЦР) «золотого стандарта», открывая возможности для большего количества приложений. в медицинской диагностике.

Выводы команды были недавно опубликованы в журнале. Передовые материалы.

«AMPLON обладает потенциалом позитивно изменить способы проведения молекулярного анализа и клинической диагностики, — сказал Мохамед С. Драз, доцент Медицинской школы и главный исследователь исследования, — от диагностики инфекционных заболеваний до персонализированной медицины и защиты окружающей среды». мониторинг».

Как это работает

Исследователи используют такую ​​технологию для сравнения ДНК больных клеток с ДНК здоровых клеток, что позволяет им лучше понять изменения, которые происходят по мере прогрессирования заболевания, и способы его лечения.

AMPLON обеспечивает несколько удлинений вдоль цепи ДНК для одновременного увеличения скорости и точности синтеза ДНК в условиях постоянной температуры.

Использование этого нового упрощенного процесса устраняет необходимость работы при экстремальных высоких и низких температурах, которые могут вызвать нагрузку на материалы. Это также делает процесс амплификации более структурированным и доступным, особенно в условиях, когда точный контроль температуры затруднен.

При использовании традиционного метода ПЦР образец ДНК нагревают, чтобы он мог разделиться на две части одноцепочечной ДНК. Затем фермент строит две новые цепи ДНК, используя исходные цепи в качестве шаблонов. Процесс утомительный, трудоемкий и дорогостоящий.

«Мы разработали новый метод амплификации ДНК, который не требует громоздкого лабораторного оборудования, но может проводиться за один этап и в различных условиях», — сказал Драз. «Что еще более важно, наш подход не ослабляет ферменты, как метод ПЦР».

Конструкция многоплечего ДНК-праймера AMPLON может превратить недостатки ферментов в сильные стороны, повысить эффективность амплификации и получить стабильные результаты.

«Нам удалось улучшить усиление и сократить время усиления на 50%», — сказал Драз. «Наш подход потенциально может радикально изменить способ проведения амплификации нуклеиновых кислот, предоставив вместо этого портативное, надежное и экономически эффективное решение для различных приложений, от диагностики на месте до полевых исследований».